資策會下一階段工作使命包括：
強化政策智庫幕僚前瞻性
研究新興產業發展機會，規劃資通訊科技、次世代台灣產業、資訊電子產業、資通安全等國家重要發展政策。對政府與產業提供國內外產業情報、政策建議、市場機會與顧問服務。並協助建構基因改造、優質網路社會、智財管理等ICT發展所需之法制環境。
推動資訊產業與社會發展
協助政府推動資通訊、科技化服務、數位內容、數位創意等重點產業發展，以及協助政府推動行動台灣、數位學習等重大計畫。同時，研發創新資訊應用，加強推動傳統產業轉型及異業結合，促進創新創意服務加值。此外，協助產業引進國際技術和資金，帶動新興產業發展。
研發前瞻技術，創新資訊應用
以「前瞻U化網路技術與應用的先驅者，及ICT enabled 創新服務的帶動者」為技術研發定位，並加強與學界合作整合研發資源，擴大研發效益。研發的重點著重在：研發新世代無線寬頻通訊技術，建構行動應用基礎環境；和研發環境感知網路應用技術，打造行動智慧新生活；以及協助產業深化資訊應用，發展科技化服務。
培育中高階專業人才
配合U-Taiwan 計畫及Web 2.0 應用趨勢，培育相關資通訊專業技術人才。此外，加強科技化服務與數位內容的專業訓練，以因應未來人才的需求。推動數位學習全球運籌中心，提供跨境遠距教學，結合國內業者力量，共同拓展國際華語文市場。
推動資訊建設促進資訊社會發展，結合業者開拓國際市場
為提升國防資訊能量，加強推動國防資訊建設與提供政府部門資安技術服務，健全資安防護功能。與業者合作，協助政府推廣與深化資訊應用，以提升政府效能及服務品質。運用本會累積之系統規劃建置經驗與能力，結合國內業者共同開拓國際資服市場，爭取商機。
拓展國際業務，擴大國際合作，邁向全球市場
透過既有之系統整合、技術研發、人才培育、及科技化服務等之成果與經驗，結合業者，開拓國際商機。並在現有的國際合作網絡基礎之上，建立國際交流平台，
進行科技外交及國際科技交流，並參與消弭國際數位落差，發展數位機會的工作。
從2007年起，資策會致力打造「陽光、健康、專業」的組織新形象，「陽光」意指資策會處事開誠佈公、為國家、產業貢獻熱情與朝氣；「健康」旨在勉勵同仁守法守紀、切實反省，透明對外溝通，注重健康，熱愛工作、優化生活；「專業」則旨在期許同仁建立專業知識與核心技能，並期為同業表率。資策會將藉此新形象自我期許，並發揚「創新、關懷、實踐」的組織文化，以「促進知識經濟（economy）、共享數位品質（e-quality）、達成數位平等（equality）」為願景，繼續為促進數位經濟發展，提升台灣資訊國力而努力。